Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms