Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms