Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB6CQ53S08 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms