Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL21-204ENST00000326092 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNORA48B-201ENST00000390912 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CABYR-205ENST00000415309 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL162431.1-202ENST00000422858 444 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL591644.1-201ENST00000436102 764 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL365356.2-201ENST00000441526 196 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GAGE12J-201ENST00000442437 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PHBP12-201ENST00000453979 811 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC003029.1-201ENST00000493495 603 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC083906.4-201ENST00000514634 987 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CD59-214ENST00000534312 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP000866.3-201ENST00000534607 433 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC025576.2-201ENST00000535806 390 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02373-201ENST00000549261 423 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC083805.2-201ENST00000549683 610 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL079307.2-201ENST00000557308 448 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP001178.2-201ENST00000580007 326 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR3150B-201ENST00000580142 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR4419A-201ENST00000583845 77 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LYPD8-202ENST00000590317 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LSP1P1-201ENST00000599825 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 pRNA.10-201ENST00000613590 89 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR12D2-206ENST00000623183 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL359736.3-201ENST00000626707 303 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DMGDH-201ENST00000255189 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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