Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NRF1Q16656 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms