Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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