Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms