Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms