Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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