Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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