Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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