Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXD13P35453 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXD13P35453 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXD13P35453 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXD13P35453 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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