Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms