Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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