Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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