Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCSER1Q9C0I3 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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