Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms