Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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