Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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