Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL22P11-201ENST00000434894 385 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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