Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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