Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms