Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms