Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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TCIRG1Q13488 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TCIRG1Q13488 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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