Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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