Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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