Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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