Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRMP28827 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PTPRMP28827 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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PTPRMP28827 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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