Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

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Length 1,435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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