Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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