Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.3 ms