Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms