Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms