Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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