Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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