Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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