Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms