Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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