Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms