Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMPOP42166 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMPOP42166 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TMPOP42166 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms