Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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