Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRCP08575 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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PTPRCP08575 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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