Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms