Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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