Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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