Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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FXNQ16595 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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FXNQ16595 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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FXNQ16595 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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