Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDGFRLQ15198 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms