Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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