Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFTN1Q14699 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms