Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms